「dangling _ in identifiers」オプションは、アンダースコア( _ )から始まる変数名（または関数名）を許可するかどうかのオプションです。デフォルト(false)では、アンダースコアから始まる変数名、関数名は許可されません。

function _func() {  //Unexpected dangling '_' in '_func'.
    "use strict";

    var foo = 1,
        _bar = 2;  //Unexpected dangling '_' in '_bar'.

    return foo + _bar;
}

_func();

上記のコードをJSLintでチェックすると、1行目、5行目でそれぞれ「Unexpected dangling ‘_’ in ‘_func’」「Unexpected dangling ‘_’ in ‘_bar’.」という警告が表示されます。
これはそれぞれ関数名、変数名の先頭がアンダースコア( _ )で始まっているためです

関数名、変数名の先頭にアンダースコアを付けるのはダメなのか？

そんなことはありません。
JavaScriptでは、言語の機能としてプライベートなメンバを定義する方法がありません。ですので、あるオブジェクトのメンバを private にしたい場合、メンバ名の先頭にアンダースコアを付加し、命名規則により private メンバであることを表す、といったことはよくあると思います。

「JavaScriptパターン―優れたアプリケーションのための作法―」には、オブジェクトのメンバ（変数、関数）が public なのか private なのかを区別するための作法の１つとして、プライベートなメソッドやプロパティの先頭にアンダースコアを付加する、という方法が紹介されています。（これ以外にも、クロージャの仕組みを応用して、プライベートメンバを実現させる方法などもあります。）

結局のところ、「dangling _ in identifiers」は開発者次第

JSLintでは、デフォルトでは変数名の先頭にあるアンダースコアに対して警告を出しますが、必ずしもこれに従う必要はないと考えます。

前述のような命名規則でプライベートであることを表したいのであれば、「dangling _ in identifiers」オプションはtrueにすべきでしょうし、命名規則ではなく、全てのプライベートメンバはクロージャによって実現させるのであれば、デフォルトのままでも良いと思います。